rozpoznanie raka jelita grubego

Ponadto podobna, bardziej rygorystyczna analiza statystyczna wszystkich trzech zestawów danych może ujawnić dodatkowe nakładanie się eksperymentów. Pomimo pewnych różnic w trybach analizy transkryptomu regulowanego przez QS, duża grupa genów była wspólna dla wszystkich trzech raportów, które wydawały się być regulowane przez QS. Stwierdzono, że większość genów regulowanych przez QS ma charakter hipotetyczny lub nieznanej funkcji. Jednak pozostałe geny zakodowały, na przykład, białka błonowe, przypuszczalne enzymy, czynniki transkrypcyjne i wydzielane enzymy zaangażowane w szeroki zakres funkcji komórkowych, w tym dwuskładnikowe systemy regulacyjne, metabolizm energetyczny, transport drobnocząsteczkowy i aparatura eksportowa. We wszystkich trzech badaniach stwierdzono, że duża liczba znanych genów jest prawdopodobnymi czynnikami wirulencji; jednak kilka innych zidentyfikowanych genów może również należeć do tej kategorii. Aby ocenić interakcje między czynnikami QS a genami regulowanymi QS, przeprowadzono analizę w celu zidentyfikowania genów regulowanych przez QS, które zawierały sekwencje konsensusowe DNA do wiązania LasR i RhlR. Niespodziewanie tylko około 7% genów regulowanych przez QS posiadało sekwencje DNA w górę, homologiczne do znanych domen wiążących LasR i RhlR, co wskazuje, że QS reguluje wiele genów za pośrednictwem mechanizmów pośrednich (11, 12). Obserwacja ta korelowała z wykazaniem, że duża liczba genów regulowanych przez QS została sklasyfikowana jako regulatory transkrypcji lub jako członkowie dwuskładnikowego systemu regulacyjnego (11). Poprzez indukowanie tych czynników regulatorowych, QS może pośrednio wpływać na wiele mechanizmów regulujących ekspresję genów, co może tłumaczyć niskie występowanie specyficznych domen wiążących DNA dla regulatorów QS. Ogólnie dane z tych trzech badań demonstrują globalne efekty QS u P. aeruginosa; jednakże pełny transkryptom regulowany przez QS może jeszcze być niekompletny. Chociaż wiele genów zostało zidentyfikowanych jako regulowane QS, ważne jest, aby pamiętać, że w różnych warunkach eksperymentalnych dodatkowe geny mogą być różnicowo regulowane przez QS. Rola P. Qus aeruginosa w patogenezie Biorąc pod uwagę, że QS reguluje tak szeroki zakres czynników, które pełnią tak różnorodne funkcje w funkcji P. aeruginosa, ważne jest zbadanie, w jaki sposób QS wpływa na patogenezę tej bakterii. Wiele badań badających QS podczas infekcji wykorzystywało szczepy P. aeruginosa, które mają delecje jednego lub więcej genów związanych z QS, oprócz szczepów typu dzikiego. Badania nad rolą P. aeruginosa QS w infekcji przy użyciu modelu spalonej myszy, mysiego modelu ostrego zapalenia płuc i szczurzego modelu przewlekłego zakażenia płuc wykazały, że delecje jednego lub więcej genów QS prowadzą do zmniejszenia P. aeruginosa. zjadliwość w porównaniu z P. aeruginosa typu dzikiego (14-17). Dane te potwierdzają, że zarówno las jak i rhl QS są ważne dla rozprzestrzeniania się P. aeruginosa, co prowadzi do posocznicy, indukuje ostre i przewlekłe infekcje płuc oraz powoduje patologię i śmiertelność. Wykazano również, że QS jest funkcjonalny podczas infekcji P. aeruginosa u ludzi. W próbkach plwociny od pacjentów z mukowiscydozą skolonizowanych przez P. aeruginosa stwierdzono, że poziomy transkryptów genów QS korelują z genami regulowanymi przez QS, co wskazuje, że QS regulowało ich ekspresję podczas infekcji (18, 19). Ponadto, AHL mierzono bezpośrednio w plwocinie pacjentów z mukowiscydozą chronicznie skolonizowanych przez P. aeruginosa (19). Łącznie, badania te wskazują, że funkcjonalne systemy QS znacząco wpływają na ciężkość zarówno ostrych, jak i przewlekłych zakażeń P. aeruginosa. Dodatkowe badania wykazały, że AHL wytwarzane przez P. aeruginosa są w stanie oddziaływać z komórkami eukariotycznymi i stymulować wytwarzanie różnych czynników, które mogą wpływać na patogenezę tej bakterii.
[hasła pokrewne: avr simulator, nowotwór wątroby, olx wołomin ]